생성모델을 이용한 실험 최적화 및 실험 가설 생성 시스템 및 방법이 제시된다. 일 실시예에 따른 생성모델을 이용한 실험 가설 생성 방법은, 실험 디자인을 구성하는 요소를 수치화하는 단계; 수치화된 상기 실험 디자인을 구성하는 요소를 전달 받아 심층 신경망 기반의 생성 모델을 이용하여 실험의 특정 실험 변수들을 인코딩하는 단계; 및 인코딩된 상기 실험 변수들의 조합을 통해 사용자가 의도한 실험 변수의 조합으로 실험을 재구성하는 단계를 포함하여 이루어질 수 있다.