본 발명에 의하면, 회전중심으로부터 반경방향을 따라 이격되어 위치하는 단위 PCR 공정부(120, 220)를 구비하며, 상기 단위 PCR 공정부는, 포획 수단(128)이 채워진 포획 통로(126)를 구비하는 표적 물질 포획부(125)와, 상기 표적 물질 포획부보다 반경방향 안쪽에 위치하며 상기 포획 통로의 입구와 연결되는 시료 저장부(130)와, 상기 표적 물질 포획부보다 반경방향 안쪽에 위치하며 상기 포획 통로의 입구와 연결되는 세척버퍼액 저장부(140, 240)와, 상기 표적 물질 포획부보다 반경방향 안쪽에 위치하며 상기 포획 통로의 입구와 연결되는 용리버퍼액 저장부(150)와, 상기 포획 통로의 출구와 연결되고 상기 출구와 멀어짐에 따라 반경방향 바깥쪽에 위치하도록 연장되는 연결 구간(162)과, 상기 연결 구간과 연결되고 상기 연결 구간의 반경방향 바깥쪽에 위치하는 폐기액 챔버(165)와, 상기 연결 구간과 연결되고 상기 연결 구간의 반경방향 바깥쪽에 위치하고 상기 폐기액 챔버보다 하류에 위치하는 표적 물질 챔버(170)를 포함하는 마이크로칩을 이용한 회전 PCR 방법이 제공된다.