본 발명의 실시 예는 현미경에 관한 것으로, 자세하게는 이중 검출 형광 공초점 현미경 장치와 장치를 이용하여 영상을 획득하는 방법에 관한 것이다. 형광물질의 3차원 영상을 얻기 위한 현미경 장치에 있어서, 형광물질을 포함하는 시편과 시편을 관찰하기 위한 대물렌즈를 구비한 시편부; 및 크기가 다른 제1 핀홀과 제2 핀홀을 구비하고 있으며, 제1 핀홀과 제2 핀홀을 각각 통과한 형광 신호의 세기를 측정하는 제1 검출기(Photomultiplier tube, PMT)와 제2 검출기를 구비한 검출부를 포함하고, 검출부는 제1 검출기와 제2 검출기에서 측정한 각 형광 신호의 세기를 통해 시편의 높이를 구하고, 3차원 영상을 획득하는 것을 특징으로 하는 공초점 현미경 장치가 제공될 수 있다.