미생물 유전체 분석 기반 타입-2 폴리케타이드 합성 효소 및 폴리케타이드 예측 시스템 및 방법

Abstract

본 발명은 미생물 유전체 분석 기반 타입-2 폴리케타이드 합성 효소 및 폴리케타이드 예측 시스템 및 방법에 관한 것으로서, 본 발명의 구성은 미생물 유전체 서열 정보를 입력받고 분석 결과를 출력하는 입출력 관리자, 폴리케타이드, 타입-2 PKS 및 타입-2 PKS 도메인 정보를 바탕으로 구성되어 있는 PKS 데이터베이스, 기계학습기를 훈련하는 기계학습 훈련부, 타입-2 PKS 도메인 예측에 사용되는 기계학습 분류부, 유전자 서열을 분석하는 서열 분석부, 유전자 클러스터를 분석하여 폴리케타이드를 예측하는 유전자 클러스터 분석부, 미생물 유전체 서열로부터 타입-2 PKS 및 폴리케타이드를 예측하여 출력 및 유전체 분석 결과 데이터베이스에 저장하는 유전체 분석부를 포함하는 것을 특징으로 하며, 본 발명에 의한 방법은 상기 기계학습 훈련부에서 타입-2 PKS 도메인 서열 정보에 기반하여 상기 기계학습 분류부의 은닉 마코프 모델 기계학습기를 훈련하는 단계(a); 상기 유전체 분석부에서 미생물 유전체 서열 파일을 입력으로 유전자 서열을 추출하는 단계(b); 상기 추출된 유전자 서열을 입력으로 상기 기계학습 분류부의 기계 학습기를 이용하는 서열 분석부를 통한 PKS 예측기를 이용하여 타입-2 PKS를 예측하는 단계(c); 상기 미생물 유전체 서열로부터 예측된 타입-2 PKS 유전자 정보들을 종합하여 탐색된 유전자 클러스터를 분석하는 폴리케타이드 예측기를 이용하여 폴리케타이드를 예측하는 단계(d); 상기 (c)와 (d) 단계에서 예측된 타입-2 PKS 및 폴리케타이드 정보를 출력하고 상기 유전체 분석 결과 데이터베이스에 저장하는 단계(e)를 포함한다.