본 발명은 문서에 포함된 모든 단어에 대하여 색인 작업을 수행하고 색인에 의해 저장된 문서 하부 구조로부터 사용자의 요구에 대하여 자료를 검색하는 전문 정보 검색 시스템에 관한 것으로 특히, 특정 문서를 입력받아 해당 문서에 존재하는 어절을 추출하는 어절 추출 모듈과, 상기 어절 추출 모듈에서 추출된 어절들에 대하여 각 어절들이 문서내에 존재하는 위치 정보를 추출하는 위치정보 추출모듈과, 상기 위치정보 추출모듈에서 추출된 각 어절들에 대한 위치정보와 각 어절에 의한 색인어를 역색인 구조로 변환 구축시키는 색인구조 구축 모듈, 및 상기 색인구조 구축모듈에서 구축된 역색인 구조를 압축하여 상기 문서 하부구조를 생성시키는 압축모듈을 포함하는 것을 특징으로 하는 한국어의 전문 정보 검색을 위한 색인 시스템과 그에 대응하는 검색 시스템을 적용하면, 문서를 색인하고 압축하는 과정에서 전문을 색인하여 정보의 손실을 최소화하며, 이러한 색인구조 구축시에 색인구조 압축알고리즘을 사용하여 저장공간을 극소화하고, 색인시에 빠른 검색기능을 제공할 수 있다.