본 발명은 레이저 유발 형광을 이용한 모세관 전기영동을 위한 다채널 형광 검출기는 레이저 광을 출하는 레이저 광원, 상기 레이저 광원에서 출사되는 광을 콜리메이팅(collimating) 시키는 콜리메이터(collimator), 상기 콜리메이터를 통해 평행광이 된 광을 반사시키는 이색거울(dichroic mirror), 상기 이색거울에서 반사된 광을 반사시키는 접이거울(folding mirror), 상기 접이거울에서 반사된 광을 마이크로채널 내에 존재하는 시료의 DNA 검출을 위한 대상물로 조사하는 대물렌즈 및 상기 대상물에 조사되어 반사된 형광신호를 다수의 채널을 가지는 광전자 증배기로 파장별로 입사받는 분광 광학계를 포함하는 것을 특징으로 한다. 이와 같이 구성되는 본 발명은 전기영동과 레이저 유도 형광 방식을 통해 DNA의 특성을 효과적으로 검출할 수 있는 장점이 있다.