본 발명은 2차원 나노구조의 재료가 반복되는 다층구조체 및 이의 제조방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 산성 관능기 또는 염기성 관능기를 포함함으로써 양전하 또는 음전하를 포함하도록 표면개질된 2차원 나노구조의 제1 재료층; 및 상기 제1 재료가 산성 관능기를 포함하는 경우에는 염기성 관능기를 포함하며, 상기 제1 재료가 염기성 관능기를 포함하는 경우에는 산성 관능기를 포함함으로써 상기 제1 재료와 반대되는 전하를 포함하도록 표면개질된 2차원 나노구조의 제2 재료층;이 교대로 적층된 다층구조체 및 이의 제조방법에 관한 것이다.