본 발명은 3차원 영상 데이터 획득 방법 및 장치에 관한 것으로서, 영상획득수단에 의하여 생성된 인간의 뇌 영상을 회질과 백질로 분리하고, 상기 피질표면을 투명도 조절과정을 통하여 3차원 영상으로 재구성하는 제1 단계; 상기 제1 단계에서 재구성된 3차원 영상에 관한 데이터에 뇌기능 자기 공명영상장치(fMRI)를 통하여 측정된 분석데이터를 융합하는 제2 단계; 상기 제2 단계에서 융합된 3차원 영상에 관한 데이터에 DTI를 통하여 측정된 상기 백질 내 섬유조직의 트랙토그래피(tractography) 데이터를 융합하는 제3 단계; 및 상기 제3 단계에서 융합된 3차원 영상에 관한 데이터를 연산하여 디스플레이하는 제4 단계를 포함하여, 3차원 공간에서 인간의 뇌 피질표면과 그 위에 오버래핑된 뇌활성화영역, 그리고 백질 내 섬유조직의 경로를 한 곳에서 동시에 보여줌으로써, 보다 양질의 정보를 사용자에게 제공할 수 있다.