본 발명은 Cas9 단백질을 포함하는 엑소솜(Cas9:EXPLOR)을 대량으로 제조하는 방법, 상기 엑소솜 제조에 사용될 수 있는 엑소솜 제조용 벡터, 상기 방법으로 제조된 Cas9 단백질을 포함하는 엑소솜 및 이를 유효성분으로 함유하는 DNA 서열 조작용 조성물에 관한 것이다. 본 발명에서 제공하는 Cas9 단백질을 포함하는 엑소솜의 제조방법을 이용하면, Cas9 단백질을 포함하는 엑소솜을 높은 수율로 제조할 수 있으므로, 상기 엑소솜을 포함하는 DNA 서열 조작용 조성물을 통해 지놈 에디팅 시스템의 전달 기술에 널리 활용될 수 있다.